PPI蛋白相互作用（Protein-Protein Interaction，PPI）是指两种或多种蛋白质分子之间通过特定的结合位点和非共价相互作用力（如氢键、静电作用、疏水作用等）形成的稳定或瞬时的结合关系。这种相互作用是细胞内生物学功能的基础，几乎参与了所有的生理和病理过程，包括信号转导、基因调控、细胞周期调控、代谢途径以及免疫反应等。根据相互作用的稳定性，PPI蛋白相互作用可以分为永久性相互作用和瞬时性相互作用。永久性相互作用通常存在于结构复合物中，例如血红蛋白的四聚体结构，而瞬时性相互作用则常见于信号转导过程中的短暂结合。根据相互作用的参与蛋白数量，PPI蛋白相互作用还可以分为二聚体相互作用（如酶与抑制剂的结合）和多蛋白复合物相互作用（如RNA聚合酶复合物）。此外，根据结合位点的特点，PPI蛋白相互作用可以分为界面相互作用和表面相互作用，不同的相互作用类型在细胞生物学功能中发挥不同的作用。PPI蛋白相互作用的破坏或异常可能导致严重的疾病，例如癌症、神经退行性疾病和自身免疫性疾病。因此，该项分析不仅有助于揭示蛋白质功能网络的运作机制，还为新药靶点的发现和药物设计提供关键依据。

一、PPI蛋白相互作用的研究技术

PPI蛋白相互作用的研究方法涵盖了多种技术手段，包括体外技术、体内技术和计算生物学方法。以下是几种常用技术的介绍：

1、酵母双杂交（Yeast Two-Hybrid, Y2H）

这是最经典的PPI检测方法之一，利用酵母菌细胞作为平台，通过报告基因的表达来判断两种蛋白质之间是否存在相互作用；它适合于大规模筛选PPI网络但可能存在假阳性和假阴性的问题。

2、免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation, Co-IP）

Co-IP通过特异性抗体将目标蛋白从细胞裂解液中沉淀出来，同时共沉淀其相互作用的蛋白质。这种方法可以在接近天然状态下检测PPI，但对蛋白质的抗体特异性要求较高。

3、 荧光共振能量转移（Fluorescence Resonance Energy Transfer, FRET）

FRET技术通过荧光标记两个相互作用蛋白质，当两者靠近时，能量从供体荧光团传递到受体荧光团，从而检测蛋白相互作用；该方法可以实时观察活细胞内的PPI。

4、质谱技术（Mass Spectrometry, MS）

质谱技术结合免疫共沉淀或亲和纯化，能够对相互作用蛋白进行高通量鉴定。这种方法可以提供相互作用蛋白的精确序列信息和翻译后修饰状态。

5、生物信息学分析

计算生物学在PPI蛋白相互作用研究中，通过蛋白质结构模拟、网络拓扑分析等手段，可以预测潜在的蛋白质相互作用关系并揭示复杂的相互作用网络。

二、PPI蛋白相互作用的生物学意义

1、细胞信号转导

许多信号通路依赖PPI蛋白相互作用完成信号传递，例如MAPK信号通路中的各级激酶通过特定的相互作用完成磷酸化级联反应。

2、基因表达调控

转录因子与其共激活因子或抑制因子之间的PPI相互作用调控基因表达，决定细胞的生物学行为。

3、细胞周期调控

在细胞周期中，周期蛋白（Cyclins）与其激酶（CDKs）形成复合物，控制细胞从一个周期阶段到下一个阶段的转换。

4、疾病机制解析

许多疾病（如癌症和神经退行性疾病）都与异常的PPI网络有关。靶向特定PPI相互作用已成为药物开发的策略。

百泰派克生物科技凭借丰富的经验和先进的技术平台，提供专业的蛋白质相互作用分析研究服务。无论是基础科学研究还是药物开发，我们都能够为客户提供高质量的数据和科学的分析方案，助力科研项目顺利推进。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

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